在溶液中能吸附带电质点或本身带有可解离基团的物质颗粒，电泳仪工作原理如蛋白质、氨基酸等，在一定的pH值条件下，于直流电场中**然会受到电性相反的电极吸引而发生移动。不同物质的颗粒在电场中的移动速度除与其带电状态和电场强度有关外，还与颗粒的大小、形状和介质黏度有关。根据这一特征，应用电泳法便可以对不同物质进行定性或定量分析，或将一定混合物进行组分分析或单个组分提取制备，电泳仪正是基于上述原理设计制造的。
电泳的影响因素很多，主要电泳仪工作原理有被分离物质的带电荷量多少、电场强度、缓冲液的pH值和离子强度及支持介质的化学惰性。