实时荧光定量PCR分析仪
定义
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)分析仪是一种用于在DNA扩增过程中实时监测荧光信号的高精度分子生物学仪器。它结合了传统PCR的核酸扩增能力与荧光检测技术,可对起始模板DNA/RNA进行精确定量、基因表达分析、病原体检测等,是分子诊断、基因研究的核心设备。
核心工作原理
PCR扩增基础
通过温度循环(变性→退火→延伸)在体外指数级扩增特定DNA片段。
荧光标记与检测
荧光探针/染料:在反应体系中加入荧光标记物(如SYBR Green、TaqMan探针),其荧光强度与PCR产物量成正比。
实时监测:每完成一次扩增循环,仪器通过光学系统检测荧光信号,生成扩增曲线。
定量原理
Ct值(循环阈值):荧光信号达到设定阈值时的循环数。Ct值与起始模板量成反比(模板越多,Ct值越小)。
标准曲线法:通过已知浓度的标准品建立Ct值-浓度对数曲线,计算未知样本浓度。
仪器核心结构
组件 | 功能 |
---|---|
热循环模块 | 精确控制温度(±0.1℃),实现快速升降温(可达6℃/秒)。 |
光学检测系统 | 多通道荧光检测器(常见4-6色),激发/发射滤光片切换,采集荧光信号。 |
反应模块 | 96孔/384孔反应板,兼容多种耗材(如0.2mL管、多联管)。 |
控制系统 | 软件驱动:设置程序(温度、时间)、荧光通道、数据采集频率。 |
数据分析软件 | 自动计算Ct值、基因表达量(ΔΔCt法)、熔解曲线分析、生成标准曲线等。 |
关键技术类型
荧光化学方法
茎环结构探针,仅与靶序列结合时发荧光,背景噪音低。
探针含报告/淬灭基团,扩增时水解释放荧光,特异性极高。
结合双链DNA发荧光,成本低,但可能结合非特异产物(需熔解曲线验证)。
SYBR Green I:
水解探针(TaqMan):
分子信标(Molecular Beacon):
多重检测能力
多色荧光通道可同时检测多个靶基因(如病原体分型、内参基因校正)。
核心应用领域
领域 | 应用场景 |
---|---|
病原体检测 | 病毒(如SARS-CoV-2、HIV)、**、**的快速定量诊断。 |
基因表达分析 | mRNA表达量测定(比较不同组织/**处理下的基因差异)。 |
基因分型与突变检测 | SNP分型、基因编辑(CRISPR)效率验证、癌症驱动突变筛查。 |
转基因检测 | 食品/作物中转基因成分定量。 |
microRNA研究 | 短链RNA定量(需特殊逆转录步骤)。 |
**研发 | 药效基因靶点表达调控分析。 |
操作流程
样本准备:提取DNA/RNA → 逆转录(RNA样本)。
反应体系配制:引物/探针、荧光染料、模板、聚合酶混合。
程序设置:
预变性(95℃, 30s)→ 循环扩增(95℃变性, 5s → 60℃退火/延伸, 30s, 40次)→ 熔解曲线分析(60℃→95℃)。
数据分析:
软件自动生成扩增曲线、熔解曲线、标准曲线,计算基因相对表达量(2<sup>-ΔΔCt</sup>)。
优势与局限
优势 | 局限性 |
---|---|
高灵敏度(可检测单拷贝基因) | 易受抑制剂影响(血色素、肝素等) |
宽动态范围(跨越7-10个数量级) | 引物/探针设计不当易导致假阴性 |
闭管操作,污染风险低 | 设备与试剂成本较高 |
快速(1-2小时完成检测) | 需严格防RNA降解(基因表达分析时) |
支持**定量与相对定量 | 依赖标准曲线(**定量需标准品) |
关键性能参数
温控精度:±0.1℃(确保扩增特异性)。
检测通道数:决定多重检测能力(常见4-6通道)。
升降温速率:>5℃/秒可缩短反应时间。
灵敏度:可检测低**1-10拷贝的模板。
通量:96孔板(中通量)vs. 384孔板(高通量)。
发展趋势
数字化PCR(dPCR):
将样本分割为微滴,实现**定量无需标准曲线,精度更高。
便携式qPCR仪:
现场快速检测(如机场、田间病原体筛查)。
自动化整合:
与核酸提取仪、液体处理工作站联用,全流程无人操作。
多重检测升级:
16色以上通道,单次检测数十种靶标。
使用注意事项
防污染措施:
分区操作(试剂准备区→样本处理区→扩增区),使用UNG酶防残留污染。
质控设置:
阴性对照(无模板)、阳性对照、内参基因(如GAPDH)。
熔解曲线验证(SYBR Green法):
确保扩增产物单一,无非特异峰。
总结
实时荧光定量PCR分析仪凭借其高灵敏度、定量准确性和操作便捷性,已成为分子诊断与生命科学研究的基石设备。从新冠疫情中的病毒载量监测,到癌症基因的精准分型,其应用深度持续拓展。随着数字化、便携化与自动化技术的融合,qPCR技术将继续推动精准医疗与即时检测的发展。
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