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实时荧光定量PCR分析仪

作者:春天 日期:2025-08-06 人气:32

实时荧光定量PCR分析仪

定义
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)分析仪是一种用于在DNA扩增过程中实时监测荧光信号的高精度分子生物学仪器。它结合了传统PCR的核酸扩增能力与荧光检测技术,可对起始模板DNA/RNA进行精确定量、基因表达分析、病原体检测等,是分子诊断、基因研究的核心设备。


核心工作原理

  1. PCR扩增基础

    • 通过温度循环(变性→退火→延伸)在体外指数级扩增特定DNA片段。

  2. 荧光标记与检测

    • 荧光探针/染料:在反应体系中加入荧光标记物(如SYBR Green、TaqMan探针),其荧光强度与PCR产物量成正比。

    • 实时监测:每完成一次扩增循环,仪器通过光学系统检测荧光信号,生成扩增曲线。

  3. 定量原理

    • Ct值(循环阈值):荧光信号达到设定阈值时的循环数。Ct值与起始模板量成反比(模板越多,Ct值越小)。

    • 标准曲线法:通过已知浓度的标准品建立Ct值-浓度对数曲线,计算未知样本浓度。


仪器核心结构

组件功能
热循环模块精确控制温度(±0.1℃),实现快速升降温(可达6℃/秒)。
光学检测系统多通道荧光检测器(常见4-6色),激发/发射滤光片切换,采集荧光信号。
反应模块96孔/384孔反应板,兼容多种耗材(如0.2mL管、多联管)。
控制系统软件驱动:设置程序(温度、时间)、荧光通道、数据采集频率。
数据分析软件自动计算Ct值、基因表达量(ΔΔCt法)、熔解曲线分析、生成标准曲线等。

关键技术类型

  1. 荧光化学方法

    • 茎环结构探针,仅与靶序列结合时发荧光,背景噪音低。

    • 探针含报告/淬灭基团,扩增时水解释放荧光,特异性极高。

    • 结合双链DNA发荧光,成本低,但可能结合非特异产物(需熔解曲线验证)。

    • SYBR Green I:

    • 水解探针(TaqMan):

    • 分子信标(Molecular Beacon):

  2. 多重检测能力

    • 多色荧光通道可同时检测多个靶基因(如病原体分型、内参基因校正)。


核心应用领域

领域应用场景
病原体检测病毒(如SARS-CoV-2、HIV)、**、**的快速定量诊断。
基因表达分析mRNA表达量测定(比较不同组织/**处理下的基因差异)。
基因分型与突变检测SNP分型、基因编辑(CRISPR)效率验证、癌症驱动突变筛查。
转基因检测食品/作物中转基因成分定量。
microRNA研究短链RNA定量(需特殊逆转录步骤)。
**研发药效基因靶点表达调控分析。

操作流程

  1. 样本准备:提取DNA/RNA → 逆转录(RNA样本)。

  2. 反应体系配制:引物/探针、荧光染料、模板、聚合酶混合。

  3. 程序设置:

    • 预变性(95℃, 30s)→ 循环扩增(95℃变性, 5s → 60℃退火/延伸, 30s, 40次)→ 熔解曲线分析(60℃→95℃)。

  4. 数据分析:

    • 软件自动生成扩增曲线、熔解曲线、标准曲线,计算基因相对表达量(2<sup>-ΔΔCt</sup>)。


优势与局限

优势局限性
高灵敏度(可检测单拷贝基因)易受抑制剂影响(血色素、肝素等)
宽动态范围(跨越7-10个数量级)引物/探针设计不当易导致假阴性
闭管操作,污染风险低设备与试剂成本较高
快速(1-2小时完成检测)需严格防RNA降解(基因表达分析时)
支持**定量与相对定量依赖标准曲线(**定量需标准品)

关键性能参数

  • 温控精度:±0.1℃(确保扩增特异性)。

  • 检测通道数:决定多重检测能力(常见4-6通道)。

  • 升降温速率:>5℃/秒可缩短反应时间。

  • 灵敏度:可检测低**1-10拷贝的模板。

  • 通量:96孔板(中通量)vs. 384孔板(高通量)。


发展趋势

  1. 数字化PCR(dPCR):

    • 将样本分割为微滴,实现**定量无需标准曲线,精度更高。

  2. 便携式qPCR仪:

    • 现场快速检测(如机场、田间病原体筛查)。

  3. 自动化整合:

    • 与核酸提取仪、液体处理工作站联用,全流程无人操作。

  4. 多重检测升级:

    • 16色以上通道,单次检测数十种靶标。


使用注意事项

  • 防污染措施:

    • 分区操作(试剂准备区→样本处理区→扩增区),使用UNG酶防残留污染。

  • 质控设置:

    • 阴性对照(无模板)、阳性对照、内参基因(如GAPDH)。

  • 熔解曲线验证(SYBR Green法):

    • 确保扩增产物单一,无非特异峰。


总结

实时荧光定量PCR分析仪凭借其高灵敏度、定量准确性和操作便捷性,已成为分子诊断与生命科学研究的基石设备。从新冠疫情中的病毒载量监测,到癌症基因的精准分型,其应用深度持续拓展。随着数字化、便携化与自动化技术的融合,qPCR技术将继续推动精准医疗与即时检测的发展。

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